Lingkungan sekolah perlu dijaga kebersihannya. Sebagai tempat belajar anak-anak, SMP Negeri 2 Waru menciptakan suasana lingkungan yang bersih dan sehat. Lingkungan yang bersih dan sehat memberikan dampak positif pada hidup kita.
Lingkungan yang sehat terwujud jika tersedia tempat sampah di masing-masing kelas. Selain itu, disediakan pula wastafel dengan sanitasi air bersih dan mengalir. Siswa diajarkan membuang sampah di tempatnya lalu mencuci tangan.
Lingkungan menjadi lebih indah dan sehat dengan tanaman hias dan kolam ikan. Lingkungan sekolah sehat, belajar pun tenang.